Computerpracticum: Zelf een fylogenetische stamboom maken
Nadat je jezelf hebt ingelezen over DNA, soorten en verwantschap in de vorige tabbladen ben je klaar voor het zelf maken van een fylogenetische stamboom. Daarvoor ga je een zelfgekozen eiwit in verschillende soorten organismen met elkaar vergelijken. Voor de inspiratie bij de eiwit-keuze; http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_proteins
Bij het maken van een stamboom gebruiken we een database. Over de hele wereld hebben wetenschappers DNA-sequenties van eiwitten bij verschillende organismen uitgezocht en ingevoerd. Deze gegevens kunnen gebruikt worden om een stamboom te berekenen. Handleiding voor deze database staat onder het tabblad "Handleiding database".
Afronding
Deze les wordt afgesloten met een kort verslag met daarin;
- Een beschrijving van de functie van het door jou gekozen eiwit
- De zelfgemaakte fylogenetische stamboom met behulp van database met uitleg
- Een analyse van de stamboom met daarin mogelijke verklaringen
Deze opdracht is voor een cijfer in de practicummap. De beoordelingsrubric staat hier;
Nadat je jezelf hebt ingelezen over DNA, soorten en verwantschap in de vorige tabbladen ben je klaar voor het zelf maken van een fylogenetische stamboom. Daarvoor ga je een zelfgekozen eiwit in verschillende soorten organismen met elkaar vergelijken. Voor de inspiratie bij de eiwit-keuze; http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_proteins
Bij het maken van een stamboom gebruiken we een database. Over de hele wereld hebben wetenschappers DNA-sequenties van eiwitten bij verschillende organismen uitgezocht en ingevoerd. Deze gegevens kunnen gebruikt worden om een stamboom te berekenen. Handleiding voor deze database staat onder het tabblad "Handleiding database".
Afronding
Deze les wordt afgesloten met een kort verslag met daarin;
- Een beschrijving van de functie van het door jou gekozen eiwit
- De zelfgemaakte fylogenetische stamboom met behulp van database met uitleg
- Een analyse van de stamboom met daarin mogelijke verklaringen
Deze opdracht is voor een cijfer in de practicummap. De beoordelingsrubric staat hier;
beoordelingsrubric.odt | |
File Size: | 6 kb |
File Type: | odt |